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🌱 來自: chemistry
如何製作一個旋轉的分子影片
先查你要的分子的SMILE
在PubChem上查:Barbituric acid
,進入查找頁面後,直接ctrl+F
(windows) or cmd+F
(mac) 搜尋SMILE
,就會找到這個分子的SMILE: C1C(=O)NC(=O)NC1=O
把SMILE轉成一個3D模型
到Convert SMILES to 3D structure,貼上你的SMILE,然後按submit
,就會得到3D模型,接著下載.pdb
檔
在VSCode裡面打開
安裝Protein Viewer - Visual Studio Marketplace,在VScode找到你剛剛的.pdb檔右鍵打開
接下來你就應該會看到如下介面:
在右下角,有一個Export Animation的選單,在Animation的選項中選擇Camera Spin
,然後按Render
,跑好後按Save,就會有你的影片檔案