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🌱 來自: chemistry

如何製作一個旋轉的分子影片

先查你要的分子的SMILE

PubChem上查:Barbituric acid,進入查找頁面後,直接ctrl+F(windows) or cmd+F(mac) 搜尋SMILE,就會找到這個分子的SMILE: C1C(=O)NC(=O)NC1=O

把SMILE轉成一個3D模型

Convert SMILES to 3D structure,貼上你的SMILE,然後按submit,就會得到3D模型,接著下載.pdb

在VSCode裡面打開

安裝Protein Viewer - Visual Studio Marketplace,在VScode找到你剛剛的.pdb檔右鍵打開

Launch Protein Viewer from File

接下來你就應該會看到如下介面:

Protein Viewer

在右下角,有一個Export Animation的選單,在Animation的選項中選擇Camera Spin,然後按Render,跑好後按Save,就會有你的影片檔案